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微生物组学大讲堂第一讲,重磅嘉宾倾情开讲!!

讲座邀请 微生物组学是继基因组学以后,生命科学与生物技术研究领域的重大突破之一,在医疗健康、农业、生态环境和工业制造等方面具有广阔的应用前景。 为传播前沿微生物组学的理论与技术,美...

比较基因组学揭示蓝藻环境适应机制见刊ISME!!

由中国科学院水生生物研究所宋立荣研究员课题组、暨南大学生命科学技术学院韩博平教授课题组、华南师范大学生命科学学院束文圣教授课题组联合研究的研究成果在《The ISME Journal》杂志上发表...

关于生态学,研究者们存在哪些分歧?

在生态学中最具争议的问题 有哪些? 关于生态与进化,科学家们已经探讨了数百年,然而至今在很多核心问题上仍难以达成共识。著名生态与进化学者论坛Eco-Evo Evo-Eco上曾发起关于最具争议的一...

08/25 17:07
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会议报名|第三届微生物组学前沿线上研讨会

第三届微生物组学前沿线上研讨会 (2020.08.28,广州) 邀请函 为深入探讨微生物组学研究的新技术、新应用、新思路,由广东美格基因科技有限公司主办的“第三届微生物组学前沿线上研讨会”将...

08/21 17:04
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会议预告|第三届微生物组学前沿线上研讨会

第三届微生物组学前沿线上研讨会 (2020.08.28,广州) 邀请函 为深入探讨微生物组学研究的新技术、新应用、新思路,由广东美格基因科技有限公司主办的“第三届微生物组学前沿线上研讨会”将...

08/18 18:23
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R语言入门系列之一

写在前面 计算机语言的学习并不困难,关键是一定要由浅入深的实际操作练习。也许最开始的比较简单,学习者一带而过没有实际操作,之后的进一步学习很可能会陷入不知所云的困境,实际操作所带...

Linux系统入门系列之一

写在前面 在生物信息分析中,通常要借助于大型服务器来处理各种数据,而Linux系统是比较通用的服务器操作系统。在Linux系统中,我们一般通过命令行指令来执行各种任务。无论是个人PC版Linux...

Perl语言入门系列之一

写在前面 Perl语言(https://www.perl.org/)最初是为文件体系处理而创作的一种多用途语言,Perl试图填补低级语言(如C、C++或汇编语言)和高级语言(如shell编程)之间的空白,使其既满足快...

什么?你竟然还不知道t-SNE降维算法!

t-SNE降维算法 在科学研究中处理高维数据的童鞋们,常常会遇到这种问题:我们明明知道自己的数据具有很好的内部特征,却无法找到合适的降维算法展示出来。由于每一个样品特征内都可能会存在一...

R语言入门系列之二

2数据管理与可视化 2.1数据预处理 在进行正式的数据分析之前,通常要对数据进行处理。而读取数据仅仅是最简单的,之后还要进行数据的筛选、排序、转换等。数据框是最方便的数据存储、管理对象...

Linux系统入门系列之二

3命令管理 3.1命令连接符 当需要一次执行多个命令的时候,可以同时输入,不同命令之间可以使用分号“;”隔开,示例如下: 上面的多命令之间是独立的,按照先后顺序执行,多个相互依赖的命令...

Perl语言入门系列之二

2.程序结构 2.1基础控制结构 ⑴比较操作符 比较操作符常用于判断语句当中,Perl中对数值和字符串的比较操作符如下表所示: 比较操作符 数值 字符串 相等 == eq 不等 != ne 小于 < lt 大于 > ...

KEGG数据库不会下载?了解下API!

KEGG数据库(http://www.kegg.jp/)也即京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes),是系统分析基因功能、基因组信息的数据库,它整合了基因组学、生物化学以及系...

2019/03/03 16:27
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KEGG数据库下载加速攻略!

在上周的文章KEGG数据库不会下载?了解下API!里,我介绍了基于KEGG API来获得所有基因的id,并通过wget遍历所有id来get基因的序列。对计算机比较了解或已经尝试过的朋友可能会意识到,虽然K...

2019/03/05 19:00
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僵尸鹿病毒,该来的都会来!

看着可爱的鹿鹿,你无论如何也不会想到,今天竟成为了僵尸的代言者。在过去的两个月里,“僵尸鹿”病毒在北美肆虐,再次将“朊病毒”这个生物学词语引入大众视野。尽管距离朊病毒的首次发现与...

2019/03/06 19:00
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R语言入门系列之三:R脚本

写在前面: 在前面两篇文章R语言入门系列之一与R语言入门系列之二中,我分别介绍了R语言中的对象与结构、数据的输入输出及可视化。基于前面的基础,今天我介绍一下R语言中基础的程序结构,来...

时隔四年,NOG数据库更新啦!

特大喜讯! 就在前天,我发现EggNOG数据库已经进行了更新,也即EggNOG 5.0,特此分享给大家。与4年前的版本EggNOG 4.5相比,物种数目增加到原来的2.5倍,其中病毒数目增加了8倍,OG数目更是增...

2019/03/11 14:22
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Linux系统入门系列之三:初识Bash

事物最外面的一层我们称之为壳(Shell),例如贝壳、地壳。壳是事物与观察者信息交流的媒介,观察者通过壳可以直观地感受、描述事物。计算机同样是如此,普通用户无法直接操作计算机的内核,...

Linux系统入门系列之四:工具命令

在上一篇文章Linux系统入门系列之三:初识Bash中,我带大家初步认识了Bash这个Linux系统中的Shell,并学习了使用vim编辑、处理文本信息。事实上Bash拥有非常多的工具命令,并且很多工具命令已...

更正:KEGG数据库病毒基因组的下载

在前面的两篇文章KEGG数据库不会下载?了解下API!与KEGG数据库下载加速攻略!中介绍了KEGG数据库蛋白序列数据的下载方法,但是在实际操作中发现两个问题: 1. 在KEGG数据库中病毒物种的命名...

2019/03/23 17:56
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