生信论文的套路
ONCOMINE从全景、亚型两个维度做表达差异分析；
临床标本从蛋白水平确认（或HPA数据库），很重要；
Kaplan-Meier Plotter从临床意义的角度阐明其重要性；
cBio-portal数据库做基因组学的分析（机制一）；
STRING互作和GO/KEGG分析探讨可能的信号通路（机制二）；
TISIDB/TIMER分析肿瘤免疫特征（机制三）。
上次分享，我们谈到科研的现状——在临床、科研中，大牛们都是占据着科研或者临床高地的人，他们都有着自己的“根据地”，而且是大山头。科研和临床新人处于起步阶段，一般是投奔大牛，直接享受“根据地”带来的实惠；如果导师科研能力不强，或者行政职务较多，要靠自己摸索，那就跟游击战类似，属于自生自灭，自力更生的放养型。
当时，芒果建议果友们力出一孔。今天我们谈另一个策略——四渡赤水。
四渡赤水是Mao Zedong一生最得意的作品，也是走向最终胜利的重要转载。四渡赤水的启示包含“田忌赛马”的部分思想——创造局部优势，然后取得全面胜利，另一个重要的启示——目标不变，策略根据实事求是的原则应变。
具体到生信分析，技术是次要的，对疾病、基因和表型的认知是首要的，但是我们的目标是发表论文。生信技能，论文写作和湿实验验证，都是为了目标——论文发表，而且尽可能是好一点的论文——的实现。
愿果友们生信技能学起来，生信论文写起来，尽快发表论文。
本文分享自微信公众号 - 芒果先生聊生信（from2019to2020）。
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