R语言单、双因素方差分析及结果可视化的简单小例子

本篇推文来自于公众号读者的投稿,编辑排版由小明完成 1、单因素方差分析 1.1 加载R包 library(ggpubr) library(rstatix) library(tidyverse) 1.2 数据准备 这里用到的是R语言的内置数据集s...

有人热捧,有人唱衰,注册安全工程师值得考吗?

注册安全工程师(英文全称 CertifiedSafety Engineer,简称 CSE),从2004年首次开考一直延续至今(2016年暂停考试),可谓源远流长。作为国家职业资格证书之一,注安的“一生”可以被概括为...

学英语:动物界的爱因斯坦001

In the natural world, you need to be smart to stay alive. But we're only just discovering that some animals are brighter than we ever imagined. Now brand new science using innov...

R语言ggplot2绘图时如何在图形中使用数学表达式作为标注文本

图形中的文本有时需要使用数学表达式,如 的2.5需要使用下标,单位 涉及到希腊字母和上标,以及一些比较复杂的大型符号,如求和符号 、积分符号 等。对此,R语言的基础包提供了完善的处理办法...

R语言ggplot2实现环形热图的简单小例子

点击上方关注我们 回顾一下需要搞定的图: 万恶之源: 昨天我们基本上可以做出这张图的大部分了,剩下的是 内圈的红色注释 ,今天尝试一下。 1、构造数据 我们在 R 里手动构造 200 个基因表达...

2021/08/11 18:11
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卧槽!这技能比R语言 / Python 更好用?我跪了!

这是我做数据分析的第600天,也是被业务数据支配的第600天: 产品:日活怎么下降了30%?拉一下昨天产品数据... 运营:我们想做个拉新活动,取一下用户行为数据... 营销:公司要定新的营销策略...

R语言ggplot2作图的时候给坐标轴添加文本π

image.png 今天用ggplot2作图y轴的标题想实现上图红框里的形式,查了一下如何实现 记录一下代码 首先是构造一份数据集 df<-data.frame(x=1,y=1) R语言ggplot2散点图并添加文本 library(extr...

R语言ggplot2作图离散变量更改坐标轴范围

首先是示例数据 image.png 使用R语言的ggplot2做一个热图 #install.packages("see") df<-read.csv("20210809_example.csv") library(ggplot2) library(see) ggplot(data=df,aes(x=gene_name...

跟着Gut学画图:R语言ggtree包画弦图的简单小例子

今天的推文内容是模仿论文 Aberrant gut microbiota alters host metabolome and impacts renal failure in humans and rodents 中的Figure3A image.png image.png R语言里circlize这个包应该...

bioconvert计算测序覆盖度并使用R语言ggplot2画折线图进行可视化展示

参考基因组下载自NCBI https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/FN433596 下载原始测序数据 最近发现了两个新方法 一个是bioconvert可以直接下载 还有一个工具是 kingfisher 这个好强大 git主页...

聊聊数据建模中,如何减少bug呢?

关于数据挖掘,很多人都会将它与数据分析当做一回事。 虽然两者在技术和范畴上较为相似,但是数据挖掘更重视从大量数据中“淘金”——挖掘出隐含的、具有潜在价值的关系、模式以及趋势,并将...

踩坑日志 | kingfisher 公共测序数据 SRA/Fastq 下载神器!

导言 前几天看到基因课的东哥提了一下kingfisher,一个看起来就是极度便利的公共测序数据下载工具。我非常感兴趣,但也确实没时间折腾,于是继续丢给师弟去看看(事实上,他肯定也有类似需求...

bioconvert:各种各样的生物信息数据格式转换工具

今天找计算测序覆盖度的时候发现了这个工具,github 主页是https://github.com/bioconvert/bioconvert;帮助文档的链接是 https://bioconvert.readthedocs.io/en/master/ 关于各种各样的文件...

生信必备:不会代码,照样分析!用这个神器要趁早

心急的伙伴,可划到文末直接免费领取【生信神器】 上次给大家介绍了仙桃生信工具,一个只需15分钟就能复现生信文章的神器,还全都是零代码!后台至今都还收到小伙伴们的“催(jia)更(liang)”...

2天让你从零基础到手握3-5生信热点分文章 线上课程8月7-8日

欢迎新老客户预定玮瑜消费预存卡 详情咨询谢先生13611825136 如你没时间参加 朋友圈转发2小时发送截图,或介绍学员,核实后可在授课结束后获得 PPT《WGCNA分析流程指南》 一份。 课程简介 示...

R语言ggtree画聚类树图的时候的报错和解决办法

之前录制了一起视频介绍了使用R语言的ggtree包可视化展示层次聚类分析结果的视频 最近好几个读者在公众号留言画图的时候遇到报错 c2741754fed0c3d43cff75ff709fe8a.png Error in DataMask$ne...

文献分享|代谢组学分析揭示了新冠肺炎的阶段性特征

来自2021 Jul 21的European Respiratory Journal。IF:16.672。 知识点 LC-MS 非靶向代谢组 技术简介 代谢组学是直接研究生物体受基因和蛋白调控的所有代谢物的变化规律和功能的科学,是探究生...

R语言ggplot2气泡图叠加图片的简单小例子

image.png 之前有人在公众号留言问这幅图的实现办法,这个是气泡图,用ggplot2很方便能够实现,但是这个图比较特殊的是横坐标还有对应的图片,当然出图以后用其他软件来编辑是可以实现的,但...

R语言计算两组数据变量之间的相关系数和P值的简单小例子~应用于lncRNA的trans-act

最近在看植物长链非编码RNA的内容,数据分析里有个一内容是预测lncRNA的反式作用元件,通常的做法是利用表达量数据计算皮尔逊相关系数,然后设置一定的阈值进行筛选 比如 Horticulture Resea...

过于真实!不会Excel的人,每天工作有多累...

你会用Excel吗? 几乎每个人的电脑里都有Excel 但不是每个人都会用 真正的Excel高手 在职场中,是非常吃香的! Excel不过关,天天要加班! 最近,我的一位会计朋友,向我哭诉,说可能要被炒鱿...

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