R语言ggplot2堆积柱形图添加误差线的简单小例子

原创
08/20 17:00
阅读数 563

最近有人在公众号后台留言问到这个问题,今天的推文介绍一下ggplot2做堆积柱形图并添加误差线的办法

完整代码

'''
堆积柱形图添加误差线
'
''
getwd()

library(ggplot2)
library(dplyr)
library(see)

df<-read.csv("penguins.csv")
head(df)


df %>% na.omit() %>% 
  group_by(species,sex) %>% 
  summarise(mean_value=mean(bill_length_mm),
            sd_value=sd(bill_length_mm)) -> df1

df1

df1 %>% 
  group_by(species) %>% 
  mutate(new_col=cumsum(mean_value)) -> df2

df2$sex<-factor(df2$sex,
                levels = c("male","female"))

ggplot(data=df2,aes(x=species,
                    y=mean_value,
                    fill=sex))+
  geom_bar(position = "stack",stat="identity")+
  geom_errorbar(aes(ymin=new_col-sd_value,
                    ymax=new_col+sd_value),
                width=0.1)+
  scale_y_continuous(expand = c(0,0),
                     limits = c(0,100))+
  scale_fill_material_d()+
  theme_bw()+
  labs(x=NULL,y="ABCD")

最终结果

image.png

首先是准备数据

这个是R语言里自带的数据集,我将其写出到一个文件里,部分数据如下

image.png

我们只用到其中的三列

  • species 企鹅的种类
  • sex 企鹅的性别
  • bill_length_mm 企鹅嘴的长度

解释代码

用到的R语言包
  • ggplot2 画图
  • dplyr 整理数据
  • see 用来配色
读取数据,查看前六行
df<-read.csv("penguins.csv")
head(df)
按照种类和性别分组计算平均值和标准差
df %>% na.omit() %>% 
  group_by(species,sex) %>% 
  summarise(mean_value=mean(bill_length_mm),
            sd_value=sd(bill_length_mm)) -> df1

df1
给数据集添加新的一列用来控制误差线的位置
df1 %>% 
  group_by(species) %>% 
  mutate(new_col=cumsum(mean_value)) -> df2
给映射颜色的变量赋予水平 (这个地方我一时还想不到如何解释,大家可以想一下为啥有这一步)
df2$sex<-factor(df2$sex,
                levels = c("male","female"))
接下来就是画图代码了
ggplot(data=df2,aes(x=species,
                    y=mean_value,
                    fill=sex))+
  geom_bar(position = "stack",stat="identity")+
  geom_errorbar(aes(ymin=new_col-sd_value,
                    ymax=new_col+sd_value),
                width=0.1)+
  scale_y_continuous(expand = c(0,0),
                     limits = c(0,100))+
  scale_fill_material_d()+
  theme_bw()+
  labs(x=NULL,y="ABCD")

画图代码在今天推文的第三条视频中会有介绍,这里就不用文字来解释了

今天的推文完整示例数据和代码可以在第二条推文的留言区获取(第二条推文是一个广告)

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