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故障分析 | binlog flush 失败导致的 Crash

爱可生
 爱可生
发布于 02/21 20:44
字数 2802
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作者:xuty 开个坑,记录自己平时由于解决问题需要或是兴趣研究进行的 MySQL 源码跟踪学习过程。

一、问题现象

某项目上出现 MySQL Crash,相关 errorlog 日志如下,从日志可以看出是 binlog error 导致的问题,但是无法确认具体原因,网上大部分资料都说是由于空间已满导致,后来在系统日志(/var/log/message)中确实找到了 / 分区空间已满的信息,所以基本可以确认 binlog error 是由于磁盘空间已满导致,进而造成 MySQL Crash。

2019-09-24T14:17:47.786460+08:00 527621 [ERROR] /usr/local/mysql/bin/mysqld: Binary logging not possible. Message: An error occurred during flush stage of the commit. 'binlog_error_action' is set to 'ABORT_SERVER'. Hence aborting the server.
06:17:47 UTC - mysqld got signal 6 ;
This could be because you hit a bug. It is also possible that this binary
or one of the libraries it was linked against is corrupt, improperly built,
or misconfigured. This error can also be caused by malfunctioning hardware.
Attempting to collect some information that could help diagnose the problem.
As this is a crash and something is definitely wrong, the information
collection process might fail.

key_buffer_size=8388608
read_buffer_size=16777216
max_used_connections=79
max_threads=2500
thread_count=35
connection_count=34
It is possible that mysqld could use up to
key_buffer_size + (read_buffer_size + sort_buffer_size)*max_threads = 122921649 K  bytes of memory
Hope that's ok; if not, decrease some variables in the equation.

Thread pointer: 0x7fbc3400ef40
Attempting backtrace. You can use the following information to find out
where mysqld died. If you see no messages after this, something went
terribly wrong...
stack_bottom = 7fbcd01d9ea8 thread_stack 0x40000
/usr/local/mysql/bin/mysqld(my_print_stacktrace+0x35)[0xf4fbe5]
/usr/local/mysql/bin/mysqld(handle_fatal_signal+0x4a4)[0x7d1f54]
/lib64/libpthread.so.0(+0xf370)[0x7fc5897fe370]
/lib64/libc.so.6(gsignal+0x37)[0x7fc5881f21d7]
/lib64/libc.so.6(abort+0x148)[0x7fc5881f38c8]
/usr/local/mysql/bin/mysqld[0xee626a]
/usr/local/mysql/bin/mysqld(_ZN13MYSQL_BIN_LOG33handle_binlog_flush_or_sync_errorEP3THDb+0x17b)[0xef289b]
/usr/local/mysql/bin/mysqld(_ZN13MYSQL_BIN_LOG14ordered_commitEP3THDbb+0x3ca)[0xef480a]
/usr/local/mysql/bin/mysqld(_ZN13MYSQL_BIN_LOG6commitEP3THDb+0x51d)[0xef4f7d]
/usr/local/mysql/bin/mysqld(_Z15ha_commit_transP3THDbb+0x174)[0x823434]
/usr/local/mysql/bin/mysqld(_Z12trans_commitP3THD+0x49)[0xdd38f9]
/usr/local/mysql/bin/mysqld(_Z21mysql_execute_commandP3THDb+0x2c89)[0xd1a1a9]
/usr/local/mysql/bin/mysqld(_Z11mysql_parseP3THDP12Parser_state+0x40d)[0xd1c86d]
/usr/local/mysql/bin/mysqld(_Z16dispatch_commandP3THDPK8COM_DATA19enum_server_command+0x11a5)[0xd1da95]
/usr/local/mysql/bin/mysqld(_Z10do_commandP3THD+0x194)[0xd1e944]
/usr/local/mysql/bin/mysqld(handle_connection+0x2b4)[0xdeffa4]
/usr/local/mysql/bin/mysqld(pfs_spawn_thread+0x174)[0xfc8f64]
/lib64/libpthread.so.0(+0x7dc5)[0x7f097d411dc5]
/lib64/libc.so.6(clone+0x6d)[0x7f097becf73d]

Trying to get some variables.
Some pointers may be invalid and cause the dump to abort.
Query (7f00a80008f0): is an invalid pointer
Connection ID (thread ID): 98525
Status: NOT_KILLED

二、问题疑惑

对于这个问题,一开始存在几点疑惑,需要实验和源码追踪验证。

  1. binlog error 是由于 / 分区空间已满造成的,为什么会造成 MySQL Crash?
  2. / 分区明明有十几个 G 的剩余空间,为什么会满?是什么文件撑满的?为啥事后空间却自动释放了? 这里就已知的知识先猜测下问题过程,是否正确则需要测试验证,内部机制可能就需要去查看源码。

大概过程如上,项目上 /tmp 默认为 MySQL 的临时文件目录,其所在分区一般为 / 分区(根分区),而 MySQL 的数据目录都存放在 /data/mysql_data 为另一个单独的分区(/data 分区),项目上一般均是如此。

#bin包默认值
datadir = /data/mysql_data
tmpdir = /tmp

/tmp 空间不足,也就是 / 分区已满的情况下,导致 binlog flush无法进行下去,抛出binlog_error的异常,导致MySQL crash`!

三、资料查阅

针对这个问题,网上进行大量资料查阅后,相关知识点总结如下:

与此次问题相关最主要的 2 个 MySQL 参数。

#bin包默认值
binlog_cache_size=32768
binlog_error_action = ABORT_SERVER

binlog_cache_size:当事务开始时,MySQL 会分配一个 binlog_cache_size 大小的缓冲区(默认 32K)给 session 用于存储二进制日志的缓存。如果事务大于 binlog_cache_size(默认 32K),线程将打开一个 临时文件 用于存储事务(默认 /tmp下), 当线程结束时,临时文件会自动被删除。

binlog_error_action:默认值为 ABORT_SERVER,会使 MySQL 在写 binlog 遇到严重错误时直接退出(即Crash动作),比如磁盘满了,文件系统不可写入等。在 ABORT_SERVER 选项下,binlog 和从库都是安全的,这是官方选择此默认值的原因。

此时我们就已经可以回答之前提的问题了~

  1. binlog error 是由于 /分区空间已满 造成的,为什么会造成 MySQL Crash
  • 因为 binlog_error_action 参数默认值为 ABORT_SERVER,在 binlog 写入错误时会选择直接退出保证 binlog 安全。
  1. / 分区 明明有十几个 G 的剩余空间,为什么会满,是什么文件撑满的,为啥事后空间却自动释放了。
  • 猜测是由于事务较大,超过了 binlog_cache_size,所以会在 /tmp(即/分区) 下生成临时文件,导致 / 分区空间不足,引起 MySQL Crash 后,空间又自动释放,所以事后看/分区空间是正常的。

四. 测试模拟

本地环境(为方便测试,与上述分区略有不同):

Filesystem           Size  Used Avail Use% Mounted on
/dev/mapper/cl-root   96G   57G   39G  60% /               <-------- datadir = /data/mysql_data
/dev/mapper/cl-tmp   3.8G   33M  3.8G   1% /data/tmp	   <-------- tmpdir  = /data/tmp

模拟 多条 SQL 组成的超大事务,在存储过程中显示开启事务,循环插入 1kw 数据,观察 tmpdir 目录使用情况.

直接在 /data/tmp 下无法看到临时文件,只有通过 lsof 命令才可以看到在 tmpdir 目录下确实生成了临时文件,且一直在增长,占用了 tmpdir 目录下的大量空间。

存储过程最终执行报错,报 No space left on device 即临时目录空间不足,但是此时 MySQL 并没有 Crash,errorlog 里未出现报错!!!

经过测试验证,当报错的时候,如果你在 同一个会话下 执行 commit 或者 再开启一个事务 就会立即触发 binlog_error_action,导致 MySQL 立即崩掉,且 errorlog 里会出现 binlog error 报错,与项目上现象一致。

PS:当 MySQL 解释器遇到 start transaction 时候会触发 commit… !!!

mysql> call test_insert();
ERROR 1026 (HY000): Error writing file '/data/tmp/ML1aShmH' (errno: 28 - No space left on device)
mysql> commit;
ERROR 1598 (HY000): Binary logging not possible. Message: An error occurred during flush stage of the commit. 'binlog_error_action' is set to 'ABORT_SERVER'. Hence aborting the server.
mysql> call test_insert();
ERROR 1026 (HY000): Error writing file '/data/tmp/ML5b0Mj6' (errno: 28 - No space left on device)
mysql> start transaction;
ERROR 1598 (HY000): Binary logging not possible. Message: An error occurred during flush stage of the commit. 'binlog_error_action' is set to 'ABORT_SERVER'. Hence aborting the server.

五、源码跟踪

跟踪 MySQL 源码验证上述猜想及测试,不感兴趣的童鞋可以直接跳过~

为了查看上述测试过程到底是在源码的哪一步最先报了错误,所以对比了 2 份 DBUG 日志,左图报错 的跟踪日志,右图不报错 的跟踪日志。

可以看到报错的跟踪日志最终是在 my_write函数 中抛出错误,而不报错的日志则正常执行完 my_write 函数。

//Write a chunk of bytes to a file
size_t my_write(File Filedes, const uchar *Buffer, size_t Count, myf MyFlags)
{
	size_t writtenbytes;
	size_t sum_written= 0;
	const size_t initial_count= Count;
	
	for (;;)
	{
		//...
		#ifdef _WIN32
		    writtenbytes= my_win_write(Filedes, Buffer, Count);
		#else
		    writtenbytes= write(Filedes, Buffer, Count); //writtenbytes为实际写入的字节数
		//...
		if (writtenbytes == Count)  //判断实际写入的字节数与要求写入的字节数是否相符
		{
		  //写入正常则直接break跳出循环,正常结束.
	      sum_written+= writtenbytes;
	      break;
	    }
		//...
	}
	//...
	if (MyFlags & (MY_NABP | MY_FNABP))
	{
	    if (sum_written == initial_count)  //写入正常走这个逻辑,返回0代表成功
	      DBUG_RETURN(0);   
	    if (MyFlags & (MY_WME | MY_FAE | MY_FNABP)) //写入过程报错走这个逻辑
	    {
	      char errbuf[MYSYS_STRERROR_SIZE];
	      my_error(EE_WRITE, MYF(0), my_filename(Filedes),
               my_errno(), my_strerror(errbuf, sizeof(errbuf), my_errno())); //打印错误信息
	    }
	    DBUG_RETURN(MY_FILE_ERROR); //返回错误
    }
    //...
}

/*
源码如上,MySQL最终会走Linux内核方法 write(Filedes, Buffer, Count)来刷新binlog缓冲至磁盘文件中。
1. Filedes 为文件号(对应/proc/mysqld_pid/fd下的文件编号)
2. Buffer 为指向所需写入缓冲的指针。
3. Count 为所需要写入的字节数。

my: fd: 51  Buffer: 0x7f24c49e9e30  Count: 27

由于 /data/tmp 磁盘已满,无法写入 Count 所需的字节数,导致 writtenbytes!=Count,然后引起了后续一系列的代码报错,最终诱发 binlog_error_action->MySQL Crash.   
*/

MySQL 源码执行 Commit 报错过程精简如下:

T@12: | >trans_commit
T@12: | | >ha_commit_trans
T@12: | | | >MYSQL_BIN_LOG::commit
T@12: | | | | >MYSQL_BIN_LOG::ordered_commit
T@12: | | | | | >MYSQL_BIN_LOG::process_flush_stage_queue
T@12: | | | | | | >binlog_cache_data::flush
T@12: | | | | | | | >MYSQL_BIN_LOG::write_cache(THD *, binlog_cache_data *, bool)
T@12: | | | | | | | | >MYSQL_BIN_LOG::do_write_cache
T@12: | | | | | | | | | >reinit_io_cache
T@12: | | | | | | | | | | >my_b_flush_io_cache
T@12: | | | | | | | | | | | >my_write
T@12: | | | | | | | | | | | | my: fd: 52  Buffer: 0x7f9ccc050db0  Count: 27  MyFlags: 20
T@12: | | | | | | | | | | | | error: Write only -1 bytes, error: 28
T@12: | | | | | | | | | | | | >my_error
T@12: | | | | | | | | | | | | | >my_message_sql
T@12: | | | | | | | | | | | | | | error: error: 3  message: 'Error writing file '/data/tmp/MLJRp8sa' (Errcode: 28 - No space left on device)'
T@12: | | | | | | | | | | | | | <my_message_sql 2281
T@12: | | | | | | | | | | | | <my_error 211
T@12: | | | | | | | | | | | <my_write 122
T@12: | | | | | | | | | | <my_b_flush_io_cache 1583
T@12: | | | | | | | | | <reinit_io_cache 367
T@12: | | | | | | | | <MYSQL_BIN_LOG::do_write_cache 7679
T@12: | | | | | | | <MYSQL_BIN_LOG::write_cache(THD *, binlog_cache_data *, bool) 8031
T@12: | | | | | | <binlog_cache_data::flush 1740
T@12: | | | | | <MYSQL_BIN_LOG::process_flush_stage_queue 8848
T@12: | | | | | >my_error
T@12: | | | | | | >my_message_sql
T@12: | | | | | | | error: error: 1598  message: 'Binary logging not possible. Message: An error occurred during flush stage of the commit. 'binlog_error_action' is set to 'ABORT_SERVER'. Hence aborting the server.'
T@12: | | | | | | | >sql_print_error
T@12: | | | | | | | | >error_log_print
T@12: | | | | | | | | | >print_buffer_to_file
T@12: | | | | | | | | | | enter: buffer: /opt/mysql-5.7.24-linux-glibc2.12-x86_64/bin/mysqld-debug: Binary logging not possible. Message: An error occurred during flush stage of the commit. 'binlog_error_action' is set to 'ABORT_SERVER'. Hence aborting the server.
2019-11-11T11:54:45.434783+08:00 12 [ERROR] /opt/mysql-5.7.24-linux-glibc2.12-x86_64/bin/mysqld-debug: Binary logging not possible. Message: An error occurred during flush stage of the commit. 'binlog_error_action' is set to 'ABORT_SERVER'. Hence aborting the server.
T@12: | | | | | | | | | <print_buffer_to_file 2109
T@12: | | | | | | | | <error_log_print 2134
T@12: | | | | | | | <sql_print_error 2148
T@12: | | | | | | <my_message_sql 2281
T@12: | | | | | <my_error 211

六、扩展内容

下图这个报错其实就是本次问题的一个日常例子,很多童鞋通过 navicate 还原 MySQL 的时候可能就会碰到这个问题,本质就是 navicate 还原数据库的时候默认会走 事务,当表数据库较大时,事务大小超过 binlog_cache_size,就会用临时表记录事务数据,当 tmdir 目录磁盘不足就会报错,但是这种情况并不会造成 MySQL Crash,因为 navicate 在还原报错后并不会继续去执行 commit另开一个事务,而是直接断开连接。

七、总结

这个问题目前在项目上很少碰到,这次也是出于好奇拿来学习探讨,下面总结下这个问题出现的场景:

1.代码中存在较大事务,超过 binlog_cache_size,高并发下生成大量临时文件,占满 tmpdir。 2.代码在事务执行过程中碰到 tmpdir 磁盘已满错误,未处理异常执行回滚,后续执行 Commit 导致。 3.代码在事务执行过程中碰到 tmpdir 磁盘已满错误,未处理异常执行回滚,继续执行碰到嵌套事务,引发 Commit 导致。

也许很多童鞋想到可以 加大binlog_cache_size 来减少临时文件的产生,但是这样会增加内存消耗,试想以下,假如 binlog_cache_size 增加到 32MB,当有 300个数据库连接 时,每个连接都会分配 32MB 的 binlog_cache(不管你用多少),那么就是将近 10G,很容易导致内存溢出,被系统 OOM。

因此 binlog_cache_size 不可能增加很多,根本解决方法是减少事务大小,避免在高并发下同时产生大量临时文件,撑满 tmpdir;另外可以增加 tmpdir 所在分区的大小。

遗留问题:

CentOS Linux release 7.3.1611 问题复现成功,commit 会导致 Crash。 CentOS Linux release 7.6.1810 问题无法复现,commit 不报错,但是会造成 binlog event 部分写。

附录:

https://blog.51cto.com/lee90/1939469 https://dev.mysql.com/doc/refman/5.7/en/replication-options-binary-log.html https://stackoverflow.com/questions/37813819/mysql-max-binlog-cache-size-vs-binlog-cache-size

© 著作权归作者所有

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